已经知道,在自然界存在着种类繁多的微生物,他们分布很广,繁殖快,在自然界物质转化过程中起着巨大作用。因此,他们和人类的生活、生产有者密切的广西,一方面,他们可以引起食品的腐败变质,造成食品工业生产的大量损失,可以引起任何动植物的病害,给人来带来巨大灾难。另一方面,他们又可以造福人来,对人类的生活、生产极为有利,如利用微生物可以制造肥料、私聊、食品、医药及化工原料,也可以利用微生物用于冶金、纺织、污水处理等各种方面。
BN软件是目前国内外对实验数据管理涵盖全的软件,目前已在美国50个州市的CDC都已经在使用,中科助腾是国内中文版的代理经销商,已在全国各级疾控中心安装调试成功200余套,覆盖除港澳台外的全国31个省和地区。并在此软件的基础上跟国家食品风险评估中心共同合作开发tranet网络,于2015年正式上线。
BioNumerics是集PFGE、色谱、光谱、表型特征数据、基因芯片、基因组序列、氨基酸序列等多种生物信息数据格式存储和处理分析的软件平台,包括数据存储、数据分析和数据分享三大功能。
模块配置:
1、软件为中文版本,具有中文界面和操作提示,方便技术人员准确、快捷地对生物信息数据进行比较筛查、分析研究、监测溯源,同时具备中英文双语言切换功能。可构建基于项目导向的多用户关系型数据库,数据库支持文本、数字、日期等格式的字段存储;数据库管理员可针对字段进行权限设置,限制其它用户对数据库字段进行编辑更改;内置搜索引擎,可实现样本字段信息及实验数据的快速检索查询等;支持多类型实验数据存储的多数据库系统,支持数据库层级划分,可更直观的展示多样本重复实验;支持Excel、csv、txt、XML等多种数据格式的数据导入及导出。
2、指纹数据模块:可用于处理电泳数据(包括凝胶电泳和毛细管电泳)、色谱数据、光谱数据等,实现用户对可变数目串联重复序列(VNTR)、 多位点串联重复序列分析(MLVA)、 基于CECE的异源双链分析(HAD)、金黄色葡萄球菌A蛋白分型(spa-typing)、AFLP标记辅助育种(AFLP-based breeding)等实验进行数据存储与分析。
3、树状分析及网络推理模块: 能对关系数据库中的多种实验数据进行聚类分析。BioNumerics通过把关系数据库中的各种记录之间,各种实验之间,用多种有效的聚类算法实现多种聚类分析,包括皮尔逊积差相关性分析、余弦相关性分析、Dice、Nei、Li、Jaccard、Jeffrey X、Ochiai相关性分析;支持UPGMA、WPGMA、Furthest Neighbor、Nearest Neighbor、Ward、Centroid、Median等多种聚类分析算法。
适用条件:
食品中微生物 电泳、光谱、色谱等数据的 聚类分析。